فصل نوین حیات حوزه علمیه قم با دعوت شیخ مؤسس از آیتالله سیدصدرالدین صدر برای حضور در این حوزه آغاز شد. وی که ساکن مشهد بود از دعوت شیخ عبدالکریم استقبال کرد و در سال 1313 ش وارد قم شد. او به عنوان يكی از مراجع بزرگ تقليد و زعيم حوزه موفق شد صدها عالم و مجتهد را پرورش دهد و بعد از وفات شيخ مؤسس، به همراه دو مرجع ديگر آیات (حجت و خوانساری) توانست حوزه را در سختترين شرايط سالهای خفقان قبل از شهريور 1320 حمايت نمايد. و منشأ خدمات ارزشمندی باشد.
در سال 1320 که قحطی شدیدی کشور را فرا گرفت، وضعیت نان در قم بسیار نامناسب بود. روزی آیتالله صدر تمام نانوایان را در منزل رئیس صنف خبازها جمع کرد و با عصبانیت به خادم خود گفت: برو نانی را که این آقایان خبازِ مسلمان و شیعه درست کردهاند بیاور...